พันธกิจของโรงเรียนบ้านหินเทิน มีทั้งหมด 9 พันธกิจ ดังนี้
1. โรงเรียนมีหลักสูตรสถานศึกษาที่ชัดเจนและเหมาะสมกับท้องถิ่น
2. จัดกระบวนการเรียนการสอนโดยยึดผู้เรียนเป็นสำคัญ
3. บริหารจัดการโดยมีส่วนร่วมของชุมชน
4. ส่งเสริมบุคลากรให้ได้รับการพัฒนาและมีความก้าวหน้าในอาชีพ
5. จัดประสบการณ์เรียนรู้ให้ผู้เรียนอย่างหลากหลาย
6. นำสื่อและเทคโนโลยีเข้ามาช่วยในการจัดการเรียนการสอน
7. จัดกิจกรรมเพื่อพัฒนาด้านร่างกายและจิตใจของผู้เรียนอย่างสม่ำเสมอและต่อเนื่อง
8. พัฒนาโรงเรียนตามแนวทางพระราชดำริและปลูกฝังการดำเนินชีวิตให้ผู้เรียนตามแนวทางปรัชญาเศรษฐกิจพอเพียง
9. สนับสนุนให้ผู้เรียนได้รับการศึกษาต่อสูงขึ้น